Příběh vychází z Goetheho románu o středověkém německém učenci Faustovi, který vyměnil svou duši za slávu, bohatství a mládí. Ten si na začátku příběhu žalostně uvědomuje, že zestárl, aniž by dosáhl skutečného poznání, proslulosti, nebo nashromáždil majetek. Mefistofeles – ďábel nabízí, že za upsání jeho duše jej omladí a splní mu všechna přání. Uvědomuje si ale Faust skutečnou cenu obchodu?
V muzikálu Doktor Faust je Mefistofeles netradičně ztvárněn dvěma postavami – mužským a ženským elementem. Ty se v průběhu inscenace doplňují. Též Doktor Faust neomládne, ale ďábel mu dopřeje nové, mladé tělo, do kterého přenese jeho duši, aby tak mohl toužebně zaujmout mladou Markétku.
Pěvecko-herecké obsazení nabízí nejen známé tváře, ale také vycházející hvězdy české muzikálové scény. Rockově laděný autorský muzikál doprovází komorní živý orchestr.